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刘智捷
发布时间:2017-02-22

基本信息

  姓名: 刘智捷 出生年月: 1984.12
  性别: 硕/博导:  
  民族: 开设课程: 普通遗传学;普通遗传学实验
  职称: 讲师 研究方向: 玉米抗逆分子生物学
  学位: 理学博士

联系方式
 办公电话:18207192678
 电子邮件:zhijie5.liu@gmail.com

个人简介
1. 硕士期间参与了“逆境条件下玉米苗期根系miRNA的表达与调控机理研究”,利用小RNA芯片技术鉴定高盐胁迫和低氧胁迫下诱导表达的miRNA,从中建立了miRNA与淹水、高盐逆境的关系,并进一步对miRNA参与的逆境响应通路进行了推测和分析。相关研究成果分别在2008年[5]和2009年[6]均发表于Annals of Botany杂志上。
2. 2008年以硕博连读的培养方式转入到博士期间的学习,并经郑用琏教授推荐到美国冷泉港Doreen Ware教授实验室交流学习三年,期间主要进一步深入探讨miRNA对渍水逆境的响应及其调控途径。通过高通量测序技术对miRNA的表达量进行了深入的定量分析;利用qPCR对miRNA以及其下游靶基因的表达进行了进一步的确认;分析了miRNA基因启动子区的顺式作用元件,构建了miRNA介导的、玉米根系细胞响应短期渍害胁迫的基因表达调控网络,阐述了miRNA在短期渍害逆境条件下参与的代谢及信号通路,并提出了miRNA介导的玉米根系细胞响应渍害的“节能假说”。相关研究成果以第一作者发表在PLoS One杂志上[4]。
3. 在冷泉港的三年期间,也参与了其他课题的研究工作:
1)参与了玉米基因组测序计划,构建了部分测序文库,为玉米B73全基因组测序提供了实验材料和分析数据。相关工作于2009年作为封页文章发表于Science杂志上[1]。
2)构建了5个玉米不同组织的小RNA文库,用于高通量测序。学习并参与了后期的数据分析。研究结果于2009年发表于PLoS Genetics杂志上[3]。
3)参与了拟南芥转录因子文库的构建工作中,共构建了由712转录因子所构成的转录因子文库。利用这一文库筛选了玉米以及拟南芥miRNA的启动子,构建了miRNA的调控网络。部分结果于2011年发表于Nature Method杂志上[2]。
4. 开展了玉米冠根中miRNA对长期淹水逆境胁迫响应的机理研究,参与了数据分析及论文的撰写、修改。研究结果进一步证实了所提出的miRNA介导的渍害响应“节能假说”,并以并列第一作者身份于2012年发表于Physiologia Plantarum杂志上[7]。

科研项目
 

发明专利及获奖情况
 

发表的论文及著作
第一作者发表:
1. Liu Z, Kumari S, Zhang L, Zheng Y*, Ware D*. Characterization of miRNAs in response to short-term waterlogging in three inbred lines of Zea mays. PLoS One, 2012;7(6):e39786. Epub 2012 Jun 29.
2. Zhai L, Liu Z, Zou X, Jiang Y, Qiu F, Zheng Y, Zhang Z*: Genome-wide Identification and Analysis of MicroRNA Responding to Long-Term waterlogging in Crown Roots of Maize Seedlings. Physiologia Plantarum, 2012. doi: 10.1111/j. 1399-3054. 2012. 01653. x.(
并列第一作者)

合作作者发表:
1. Schnable PS, Ware D, Fulton RS, Stein JC, Wei F, Pasternak S, Liang C, Zhang J, Fulton L, Graves TA, Minx P, Reily AD, Courtney L, Kruchowski SS, Tomlinson C, Strong C, Delehaunty K, Fronick C, Courtney B, Rock SM, Belter E, Du F, Kim K, Abbott RM, Cotton M, Levy A, Marchetto P, Ochoa K, Jackson SM, Gillam B, Chen W, Yan L, Higginbotham J, Cardenas M, Waligorski J, Applebaum E, Phelps L, Falcone J, Kanchi K, Thane T, Scimone A, Thane N, Henke J, Wang T, Ruppert J, Shah N, Rotter K, Hodges J, Ingenthron E, Cordes M, Kohlberg S, Sgro J, Delgado B, Mead K, Chinwalla A, Leonard S, Crouse K, Collura K, Kudrna D, Currie J, He R, Angelova A, Rajasekar S, Mueller T, Lomeli R, Scara G, Ko A, Delaney K, Wissotski M, Lopez G, Campos D, Braidotti M, Ashley E, Golser W, Kim H, Lee S, Lin J, Dujmic Z, Kim W, Talag J, Zuccolo A, Fan C, Sebastian A, Kramer M, Spiegel L, Nascimento L, Zutavern T, Miller B, Ambroise C, Muller S, Spooner W, Narechania A, Ren L, Wei S, Kumari S, Faga B, Levy MJ, McMahan L, Van Buren P, Vaughn MW, Ying K, Yeh CT, Emrich SJ, Jia Y, Kalyanaraman A, Hsia AP, Barbazuk WB, Baucom RS, Brutnell TP, Carpita NC, Chaparro C, Chia JM, Deragon JM, Estill JC, Fu Y, Jeddeloh JA, Han Y, Lee H, Li P, Lisch DR, Liu S, Liu Z, Nagel DH, McCann MC, SanMiguel P, Myers AM, Nettleton D, Nguyen J, Penning BW, Ponnala L, Schneider KL, Schwartz DC, Sharma A, Soderlund C, Springer NM, Sun Q, Wang H, Waterman M, Westerman R, Wolfgruber TK, Yang L, Yu Y, Zhang L, Zhou S, Zhu Q, Bennetzen JL, Dawe RK, Jiang J, Jiang N, Presting GG, Wessler SR, Aluru S, Martienssen RA, Clifton SW, McCombie WR, Wing RA, Wilson RK*: The B73 maize genome: complexity, diversity, and dynamics. Science 326(5956): 1112-1115, 2009.
2. Gaudinier A, Zhang L, Reece-Hoyes JS, Taylor-Teeples M, Pu L, Liu Z, Breton G, Pruneda-Paz JL, Kim D, Kay SA, Walhout AJM, Ware D, Brady SM. Enhanced Y1H assays for Arabidopsis. Nature methods, 2011. 8: 1053-1055.
3. Zhang L, Chia JM, Kumari S, Stein JC, Liu Z, Narechania A, Maher CA, Guill K, McMullen MD, Ware D*: A genome-wide characterization of microRNA genes in maize. PLoS Genet 5(11): e1000716, 2009.
4. Zhang Z, Wei L, Zou X, Tao Y, Liu Z, Zheng Y*: Submergence-responsive MicroRNAs are potentially involved in the regulation of morphological and metabolic adaptations in maize root cells. Ann Bot 102(4): 509-519, 2008. 被引用次数:37. IF (2008): 3.501
5. Ding D, Zhang L, Wang H, Liu Z, Zhang Z, Zheng Y*: Differential expression of miRNAs in response to salt stress in maize roots. Ann Bot 103(1): 29-38, 2009.

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