学习及工作经历

2021.05-至今 华中农业大学 植物科学技术学院 作物遗传改良国家重点实验室 教授

2019.11-2021.01 普渡大学 博士后

2019.05-2020.01 中国科学院分子植物科学卓越创新中心 生物学 博士后

2016.01-2019.04 华中农业大学 生物学 博士后

2009.09-2015.12 华中农业大学 作物遗传育种 博士

2005.09-2009.06 华中农业大学 农学 学士

研究领域

染色质是真核生物遗传物质的载体。染色质状态是基因组序列外的第二套遗传密码，由DNA甲基化、组蛋白修饰和核小体排列等多种表观遗传修饰决定；染色质三维空间构象为基因组活动提供空间平台。染色质状态及三维空间构象在基因组转录调控和生长发育中均发挥重要作用。本课题组以甘蓝型油菜和拟南芥等为主要研究对象，综合利用遗传学、分子生物学、多组学和生物信息学等手段，研究植物表观遗传调控机制及其在基因转录调控和重要农艺性状形成中的功能；从亚基因组层面解析农艺性状形成的调控机制及其表观遗传学基础；最终，运用CRISPR及其衍生技术，改造顺式调控元件的表观遗传修饰和远程交互作用，调控基因表达和性状形成，进行油菜遗传改良。

本课题组将长期从事表观遗传学、表观基因组学和三维基因组学研究，热诚欢迎有志从事作物遗传改良和生物信息分析的学生报考本实验室硕士、博士研究生。同时，本实验室招聘生物学实验和生信分析博士后若干名，有意者请将个人简历发送至本人邮箱。

1. 华中农业大学新进高层次人才科研启动项目. 2021-2025. 主持

2. 植物DNA甲基化相关的三维基因组学研究. 上海市“超级博士后”资助. 上海市人力资源和社会保障局. 2019-2020. 主持

3. 植物eChIP-seq技术的建立与甘蓝型油菜表观基因组图谱的构建. 国家自然科学基金. 2018-2020. 主持

4. 植物高效ChIP-seq技术的建立及其应用. 中国博士后基金. 2017-2018. 主持

5. 水稻三维基因组结构及其与表观遗传修饰的关系研究. 国家自然科学基金. 2018-2021. 参与

6. 适合机械化生产的甘蓝型油菜株型性状QTL定位. 国家自然科学基金. 2009-2012. 参与

学术论文

1. Zhao L, Jing X, Chen L, Liu Y, Su Y, Liu T, Gao C, Yi B, Wen J, Ma C, Tu J, Zou J, Fu T, Shen J^*. Tribenuron-methyl induces male sterility through anther-specific inhibition of acetolactate synthase leading to autophagic cell death, Molecular Plant, 2015. 8(12):1710-1724. doi: 10.1016/j.molp.2015.08.009.

2. Zhao L^#, Deng L^#, Zhang Q, Jing X, Ma M, Yi B, Wen J, Ma C, Tu J, Fu T, Shen J^*. Autophagy contributes to sulfonylurea herbicide tolerance via GCN2-independent regulation of amino acid homeostasis. Autophagy. 2018. 14(4):702-714. doi: 10.1080/15548627.2017.1407888.

3. Zhao L^#, Wang S^#, Cao Z^#, Ouyang W, Zhang Q, Xie L, Zheng R, Guo M, Ma M, Hu Z, Sung WK, Zhang Q, Li G^*, Li X^*. Chromatin loops associated with active genes and heterochromatin shape rice genome architecture for transcriptional regulation. Nature Communications. 2019. 10(1):3640. doi: 10.1038/s41467-019-11535-9.

4. Zhao L^#, Xie L^#, Zhang Q^#, Ouyang W, Deng L, Guan P, Ma M, Li Y, Zhang Y, Xiao Q, Zhang J, Li H, Wang S, Man J, Cao Z, Zhang Q, Zhang Q, Li G^*, Li X^*. Integrative analysis of reference epigenomes in 20 rice varieties. Nature Communications. 2020. 11(1):2658. doi: 10.1038/s41467-020-16457-5.

5. Zhang Q^#, Guan P^#, Zhao L^#, Ma M, Xie L, Li Y, Zheng R, Ouyang W, Wang S, Li H, Zhang Y, Peng Y, Cao Z, Zhang W, Xiao Q, Xiao Y, Fu T, Li G*, Li X* & Shen J*. Asymmetric epigenome maps of subgenomes reveal imbalanced transcription and distinct evolutionary trends in Brassica napus. Molecular Plant. 2021. 14(4):604-619. doi: https://doi.org/10.1016/j.molp.2020.12.020.

6. Tang K^#, Zhao L^#, Ren Y^#, Yang S, Zhu JK, Zhao C^*. The transcription factor ICE1 functions in cold stress response by binding to the promoters of CBF and COR genes. Journal Integrative Plant Biology. 2020. 62(3):258-263. doi: 10.1111/jipb.12918.

7. Peng Y^#, Xiong D^#, Zhao L, Ouyang W, Wang S, Sun J, Zhang Q, Guan P, Xie L, Li W, Li G^*, Yan J^*, Li X^*. Chromatin interaction maps reveal genetic regulation for quantitative traits in maize. Nature Communications. 2019 14;10(1):2632. doi: 10.1038/s41467-019-10602-5.

8. Wang G, Zhang X, Huang W, Xu P, Lv Z, Zhao L, Wen J, Yi B, Ma C, Tu J, Fu T, Shen J. Increased seed number per silique in Brassica juncea by deleting cis-regulatory region affecting BjCLV1 expression in carpel margin meristem. Plant Biotechnology Journal. 2021. doi:10.1111/pbi.13664.

9. Huang P^#, Huang H^#, Lin X, Liu P, Zhao L, Nie WF, Zhu JK, Lang Z. MSI4/FVE is required for accumulation of 24-nt siRNAs and DNA methylation at a subset of target regions of RNA-directed DNA methylation. Plant Journal. 2021. doi: 10.1111/tpj.15441.

10. Xie L, Liu M, Zhao L, Cao K, Wang P, Xu W, Sung WK, Li X, Li G. RiceENCODE: a comprehensive epigenomic database as rice Encyclopedia of DNA Elements. Molecular Plant. 2021. doi: 10.1016/j.molp.2021.08.018.

出版著作

1. 赵伦，沈金雄. 第六章, 油菜化学杀雄杂种利用研究. 涂金星等著. 油菜杂种优势利用的生物学基础.2018. 北京, 科学出版社. ISBN 978-7-03-058545-5. 219-236页

博士后招聘信息

http://rsc.hzau.edu.cn/info/1013/2790.htm